بعد خمسة عشر عامًا من الحدث الكارثي المعروف باسم الاصطدام الثاني، يواجه العالم تهديدًا جديدًا: كائنات سماوية وحشية تسمى الملائكة تغزو طوكيو-3 واحدًا تلو الآخر. البشرية غير قادرة على الدفاع عن نفسها ضد الملائكة على الرغم من استخدام ذخائرهم وتكتيكاتهم العسكرية الأكثر تقدمًا. الأمل الوحيد لخلاص الإنسان يقع في أيدي NERV، وهي منظمة غامضة يقودها البارد جيندو إيكاري. تدير NERV روبوتات بشرية عملاقة يطلق عليها اسم "Evangelions" لمحاربة الملائكة بأحدث الأسلحة المتقدمة والحواجز الواقية المعروفة باسم حقول الإرهاب المطلق.
